Laboratorium merupakan salah satu unsur penting dalam mendukung kegiatan belajar mengajar di sekolah, khususnya untuk bidang ilmu pengetahuan alam (fisika, biologi, dan kimia) yang menuntut adanya pembuktian antara teori yang didapatkan dengan realita yang sebenarnya.
SMP IT Anugerah Insani memiliki Fasilitas Laboratorium yang dapat digunakan oleh siswa untuk berbagai pembelajaran dan penelitian di bidang ilmu pengetahuan alam.